咪喹莫特乳膏功效作用其实是通过免疫抑制来治疗尖锐湿疣，尤其是外生殖器和肛周的尖锐湿疣，临床上广泛使用。尖锐湿疣是一种病毒性疾病，主要是人乳头瘤病毒感染后引起的皮肤赘生物。如果肿瘤不是很大且单发，可以用喹莫特乳膏治疗，2-3周即可达到明显的治疗效果。

但从目前的临床研究来看，一般不建议使用咪喹莫特乳膏治疗直肠或肛管尖锐湿疣，因为烧灼效果明显，可能会引起出血，且容易复发。咪喹莫特乳膏临床上用于治疗成人外生殖器疣或肛门疣、尖锐湿疣。但是这种药物的作用机制，也就是咪喹莫特乳膏如何起作用的，并不清楚，在动物实验中已经显示出一定的疗效。因为咪喹莫特乳膏能诱导产生包括干扰素α在内的细胞因子，即能诱导免疫反应，从而治疗相应的上述疾病。

在临床使用中，需要注意的是，咪喹莫特乳膏是处方药，应在医生、医院的规范化诊断和治疗。以及适应症都有明确的规定。药过程中应排除对药物的过敏反应如果存在过敏反应，则不适合应用。另外，用药过程中还要注意睡前使用，药物要在用过的部位停留6分钟-用温和的肥皂或水清洗药物10小时。用药后可出现局部红斑、糜烂、表面脱落，浮肿都是正常现象，需要透过气服。