南京有很多医院可以治疗牛皮癣，具体选择哪家医院需要按照自己的实际情况进行选择。以下是一些选择医院时需要考虑的因素：

1. 医院规模：医院的规模一般都与其综合实力、专业水平有关。较大规模的医院设备齐全、专业人员较多，可以提供更全面、更高质量的诊疗服务。

2. 专家数量：一家医院能够聘请的专家人数与质量是至关重要的。牛皮癣是一种慢性皮肤病，需要由专业的皮肤科医生进行治疗。选择专业医生治疗，同时也需要考虑专家的年龄、经验和声誉等方面。

3. 设备设施：医院设备设施是否先进也是选择医院的一个非常重要的考虑因素。在治疗牛皮癣时，要用到许多设备和仪器，如超声波诊断仪、CO2激光仪器、紫外线照射设备等等。所以，医院的设备设施是否完善直接关系到治疗效果。

4. 治疗技术：医院与专家的治疗技术是评估医院综合实力和专业水平的一个关键因素。牛皮癣治疗方法有很多种，如中药内服、外用药膏、紫外线照射、激光治疗等等。选择一家治疗牛皮癣专业的医院，可以获得更加高效、安全的治疗方式。

根据以上因素，南京治疗牛皮癣比较好的医院有：南京中西医结合皮肤病研究院、江苏省人民医院、南京市第二医院。这三家医院均为正规医院，设备齐全、专家人数较多，疗效显著，值得尝试。当然，具体选择哪家医院需要按照自己的实际情况进行判断。